https://drive.google.com/drive/folders/1XzJEBFfBcQi8iMHWZ-zaQwUzZNN36eEe?usp=sharing

He dedicado unos meses al desarrollo de una aplicación para automatizar el proceso de seccionar modelos grandes para poderse imprimir en múltiples impresoras pequeñas.


La aplicación permite cortar trozos que son difíciles de imprimir o que se desea separar. Este proceso es rápido y sencillo, basta que el usuario dibuje sobre el modelo como desea realizar el corte

Con el modelo pre seccionado, se puede pasar a cortar los componentes principales en cubos que quepan en la impresora del usuario.
TotalSegmentor: Segmentación y etiquetado automatizado con modelos de Inteligencia Artificial pre entrenados
La segmentación de estructuras anatómicas a partir de imágenes médicas es un proceso complejo y demorado, pero con el desarrollo actual en inteligencia artificial, nuevas herramientas están pareciendo para facilitar este trabajo.
TotalSegmentor es una nueva herramienta de segmentación automática de hasta 117 estructuras anatómicas que funciona gracias a modelos pre-entrenados sobre una gran cantidad de imágenes segmentadas, esto ha permitido a los modelos de IA entender las imágenes y realizar la segmentación.

Modelos pre entrenados a por Jakob Wasserthal integración en el popular programa de segmentación 3D Slicer realizado por Jakob Wasserthal de Perklbas.
Dentro del programa de 3D Slicer, se puede instalar el Plug-In TotalSegmentor y utilizar de forma local la tarjeta gráfica para procesar los volumenes.
El resultado suele ser de baja resolución y con algunos errores, pero puede ser muy útil como punto de partida para una segmentación manual más refinada o para investigación en medicina.
Utilizando bases de datos abiertas a la investigación y programas de código abierto 3D Slicer, fue posible realizar segmentaciones de alta precisión para cuantificar los daños a pulmones afectados por Covid-19

Esta es una sección de un TAC que ha sido segmentado según la densidad del tejido pulmonar, se puede apreciar como la parte posterior de los pulmones se empieza a compactar y a deteriorar.

Aquí se puede apreciar como se vería el pulmón sin las zonas que han sido afectadas por la enfermedad, y se puede ver con facilidad donde ha sido más afectado.
3D reconstruction of a Lung with Covid-19 by makemarco on Sketchfab
La fotogrametría permite rápidamente obtener modelos 3D de alta calidad de piezas con morfología compleja, en este caso, un bajo relieve que estaba en un museo, una obra que me atrajo por sus detalles y por que era un ejemplo ideal para realizar escaneo 3D por fotogrametría.




La superficie difuza con micro detalle era perfecta para fotogrametría, y la iluminación homogenea facilitó mucho el proceso.
la captura la hice con un móvil de buenas prestaciones, un Samsung Galaxy S20 FE.
Las fotos se deben tomar conm mucho solape y desde diversos ángulos, esto garantiza que el programa pueda reconstruir lo mejor posible el modelo.

En esta imñagen se puede ver como el programa posiciona las imagenes y reconstruye el modelo 3D.


El resultado es en verdad soprendente, para haber sido mediante un móvil y tomas manuales, con cámaras profesionales y trípode, se podría obtener un resultado un poco mejor y con menos imágenes.
El modelo incluye zonas que no son de interes y que han quedado incompletas, además que es un modelo muy pesado, de más de 600 megas, por lo que un paso de limpieza, retopología y optimización le vendría bien.

Este es el modelo importado en Zbrush (he dejado el material por defecto, que es similar al de la obra original)
BasRelief_SD by makemarco on Sketchfab
Acá se puede ver una prueba de baja resolución del modelo, después de limpiar y optimizar.
La impresión 3D ha tenido gran acogida en trauma y ortopedia por ser una gran ayuda para entender la relación entre todos las estructuras y para planear las cirugías.



Este es el caso de un pie que había sufrido un trauma y ya había sido intervenido, pero querían hacer otra cirugía para corregir los resultados después de un periodo de curación.

Mediante el uso de segmentación médica se pudo extraer la información del tejido oseo y corregir los artefactos de las imágenes medicas.
Con ese modelo, se procedió a imprimir el modelo


Los modelos anatómicos son muy útiles para todo tipo de aplicaciones, y poco a poco más doctores se están dando cuenta de sus beneficios para todo tipo de cirugías.
Entre los beneficios que ofrecen los modelos anatómicos son la facilidad de comunicación con el paciente, con el equipo de cirugía y la plantación del tratamiento.
Una vez terminado el tratamiento, estos modelos son excelentes recursos para la enseñanza de medicina y la comunicación en congreso y reuniones.
El encuentro anual de la Asociación de Radiólogos de Norteamérica se celebrara del 28 de noviembre al 2 de diciembre del 2021, dos años desde el último evento debido a las restricciones de la pandemia.
Quería recordar algunas de las cosas que se vieron en el 2019.

En 2019 fue el año en que la inteligencia artificial entro en la atención de la mayor parte del mundo, con los avances en deep learning y computer vision.






El RSNA 2019 vió de nuevo un aumento en el número de expositores en la zona de impresión 3D, con materiales y máquinas nuevas, al igual que nuevos programas para segmentación medica enfocados a impresión 3D ya con certificación de la FDA.


Fue muy interesante ir y hablar con los diversos eexpositores de las empresas más importantes de impresión 3D, ver sus avances y recibir consejos sobre procesos novedosos.

La sección de impresión 3D se vio expandida para incluir también las tecnologías de visualización avanzada, en la imagen se puede ver un ejemplo de proyección 3D sin necesidad de gafas, una tecnología muy interesante para la rápida visualización de casos complejos de forma colaborativa.



Mi parte favorita es por supuesto ver y probar lás últimas máuinas y programas del campo, da una verdadera idea de lo rápido que está avanzando y de todas las oportunidades que hay.



Es importante no ilvidar que Chicago, la ciudad donde se realiza el encuentro anual del RSNA, es también una ciudad extraordinaria con muchas cosas para ver y hacer.


También hay cosas interesantes para comer!
El mundo pequeño que nos rodea siempre es sorprendente. Solo hace falta tener una lupa(o un lente macro) para poder verlo en detalle.
Estas fotos fueron tomadas con una cámara Sony a7RM2 con un lente Sony 90mm F2.8 macro.















